Tak hanya di Jawa Barat, gerakan DI/TII juga menyebar ke Sumatera, terutama Aceh dan Sulawesi. Akhirnya, DI/TII berhasil ditumpas oleh pasukan Kodam Siliwangi.
Setelah Kartosoewirjo ditangkap TNI dan dieksekusi pada 1962, gerakan ini terpecah. Namun doktrin DI/TII masih eksis secara diam-diam sampai saat ini.
Tiga tahun kemudian, terjadi kudeta Gerakan 30 September/Partai Komunis Indonesia (G30 S/PKI) pada 1965. Akibat peristiwa ini, 6 jenderal dan 1 perwira pertama TNI gugur.
Sedangkan jutaaan anggota PKI di seluruh Indonesia tewas dieksekusi dan dan dipenjara. Ada juga anggota PKI yang diasingkan ke bebarapa daerah, terutama Pulau Buru.
Walaupun Indonesia telah 78 tahun merdeka, namun pemberontakan, gerakan separatis, dan upaya memecah belah bangsa masih saja terjadi. Salah satu gerakan separatis yang masih merongrong kedaulatan NKRI adalah Organisasi Papua Merdeka (OPM).