Generasi Ketiga (1999)
Dalam perubahan model penuh, Pajero mengalami perubahan evolusi yang signifikan saat bermetamorfosis menjadi manifestasi generasi ketiga pada September 1999. Perubahan besar termasuk penggantian konstruksi rangka dan bodi yang sebelumnya terpisah dengan konstruksi monocoque sangat kuat, di mana rangka merupakan bagian integral bagian dari cangkang bodi. Panjang keseluruhan, lebar dan jarak sumbu roda juga bertambah.
Penurunan berat dan peningkatan kekakuan menghasilkan kendali dan stabilitas yang sangat baik serta kenyamanan berkendara. 3.5L V6 GDI dan mesin disel baru 3.2L Di-D diesel direct-injection ditambahkan ke dalam lini, memberikan daya keluaran tinggi, menghasilkan torsi tinggi, serta mengembalikan konsumsi bahan bakar yang sangat baik.
Sistem Super Select 4WD, yang menggabungkan manfaat dari 4WD paruh waktu dan penuh, telah berevolusi menjadi SS4-II dengan drive mode selector elektrik untuk membawa peningkatan besar dalam nuansa operasional. Suspensi serba independen dengan double-wishbone koil di depan dan dengan pengaturan multi-link di belakang dan bekerja bersama dengan wheelbase dan stroke suspensi yang lebih panjang membawa peningkatan signifikan dalam stabilitas di kecepatan tinggi juga keunggulan performa Pajero di semua medan.
Generasi keempat (2006)
MMC meluncurkan Mitsubishi Pajero generasi keempat pada 2006. Saat itu Mitsubishi Pajero telah terjual lebih dari 2,5 juta unit di lebih 170 negara di dunia. Pajero telah membangun reputasi yang kuat di antara para pelanggan sebagai SUV serba guna yang memberikan performa off-road dan berbagai medan dengan performa jelajah berkecepatan tinggi dan kenyamanan sebuah sedan.
Dalam pengembangan, Pajero generasi keempat menjalani serangkaian program pengujian dengan kondisi paling keras. Ini termasuk pengujian simulasi kompatibilitas di ketinggian 2.500 meter Pegunungan Alpen, Eropa, suhu minus 40 derajat di Eropa Utara, termasuk dikemudikan di jalur off-road gurun Afrika dan pedalaman Australia.