Dia mengenyam pendidikan di Hollandsch-Inlandsche School Kebumen pada 1936 sampai 1942. Soenardi lalu melanjutkan pendidikan di SMP Negeri 2 Yogyakarta dan SMA B1 N yang kini dikenal SMA Negeri 3 Padmanaba.
Kondisi perang pascakemerdekaan memaksanya keluar dari sekolah dan ikut mengangkat senjata membela tanah air. Dia bergabung menjadi anggota Tentara Pelajar di Kebumen pada 1947.
Setahun berselang, dia berjuang bersama TNI di selatan Yogyakarta. Kemudian pada 1949, Soenardi kembali ke bangku sekolah. Dia masuk SMA De Brito dan berhasil menamatkan studinya pada 1952.
Kemudian dia mengenyam pendidikan tinggi di Fakultas Pertanian UGM. Kiprahmnya di UGM yakni menjadi salah satu penggagas pendirian Fakultas Kehutanan yang diresmikan pada 17 Agustus 1963.
Pada 1959, Soenardi menerima beasiswa di University of British Columbia, Kanada. Dia menamatkan studi S1-nya dua tahun kemudian.