Pada 2009, Ahok terpilih sebagai anggota DPR RI melalui Partai Golkar. Dia fokus pada isu-isu reformasi birokrasi dan anti-korupsi. Pada 2012, dia bergabung dengan Partai Gerindra dan mendampingi Joko Widodo (Jokowi) sebagai calon Wakil Gubernur DKI Jakarta. Mereka memenangkan Pilkada DKI Jakarta pada 2012.
Setelah Jokowi menjadi Presiden pada 2014, Ahok diangkat menjadi gubernur. Dia melanjutkan upaya reformasi birokrasi dan memperkenalkan sistem e-Budgeting untuk memastikan transparansi anggaran. Ahok juga fokus pada perbaikan pelayanan publik dan penanggulangan masalah banjir serta kemacetan di Jakarta.
Gaya kepemimpinannya yang langsung dan blak-blakan sering kali menimbulkan kontroversi.
Pada September 2016, Ahok menjadi sorotan karena pernyataannya yang mengutip ayat Al-Qur'an dalam pidato. Pernyataannya dianggap menghina agama oleh banyak kelompok yang memicu protes besar-besaran.
Setelah proses hukum yang panjang, Ahok dijatuhi hukuman 2 tahun penjara pada Mei 2017 dan menjalani hukuman di Rutan Mako Brimob, Depok, hingga dibebaskan pada Januari 2019.