Lukisan berjudul Balinese Procession adalah salah satu karya termahalnya. Lukisan tersebut menggambarkan kehidupan sehari-hari di Bali.
Lukisan ini menyajikan kesan hangat, lembut, dan tenang. Balinese Procession terjual dengan harga Rp27,28 miliar di balai lelang Sotheby’s Hong Kong pada April 2017.
S. Sudjojono juga memiliki karya heroik berjudul "Pasukan Kita di Bawah Pimpinan Pangeran Diponegoro". Lukisan ini dapat dikatakan menunjukkan visi kreatif dan dogma politik besar Sudjojono.
Lukisan ini berusaha menggambarkan kemenangan Pangeran Diponegoro dan pasukannya melawan Belanda dalam Perang Jawa yang berlangsung antara tahun 1825-1830. Karya ini bisa direpresentasikan sebagai seruan untuk merayakan perlawanan terhadap penindasan meski telah jatuh.
Lukisan berjudul 'Pasukan Kita yang Dipimpin Pangeran Diponegoro' terjual di balai lelang Sotheby’s Hong Kong pada 5 April 2014 seharga 58,36 juta dollar Hongkong atau setara Rp85,20 miliar (kurs saat itu) atau lebih dari Rp116 miliar kurs saat ini.