Candi Cetho
Candi misterius yang ada di Indonesia urutan pertama adalah Candi Cetho. Candi ini terletak di Gunung Lawu pada ketinggian 1496 mdpl. Lokasi tepatnya, yakni di Dusun Ceto, Kecamatan Jenawi, Karanganyar, Jawa Tengah. Candi ini diyakini dibangun pada masa-masa akhir era Majapahit.
Namun, ada keanehan terkait keyakinan tersebut. Sebab, bangunannya yang terbuat dari batu kali. Padahal, candi era Majapahit diketahui terbuat dari batu bata merah. Selain itu, relief Candi Cetho juga misterius karena tidak menggambarkan orang Jawa pada masa itu, melainkan mirip orang-orang Sumeria.
Candi Sukuh
Candi Sukuh juga menjadi salah satu candi misterius yang ada di Indonesia. Letaknya tidak begitu jauh dari Candi Cetho, yaitu di Gunung Lawu, tepat di Karanganyar, Jawa Tengah. Hal yang membuat Candi Sukuh ini misterius yakni karena bentuk bangunan candi Sukuh cenderung mirip dengan peninggalan budaya Maya di Meksiko atau peninggalan budaya Inca di Peru. Struktur ini juga mengingatkan para pengunjung akan bentuk-bentuk piramida di Mesir.
Candi Penataran
Candi misterius yang ada di Indonesia urutan terakhir yaitu Candi Penataran. Candi Penataran ini terletak di Nglegok, Kabupaten Blitar, Jawa Timur. Serupa dengan candi-candi yang disebutkan di atas, Candi Penataran ini juga menunjukkan relief-relief yang janggal. Sebab, relief-reliefnya menunjukkan orang-orang dari bangsa asing seperti dari suku Maya di Meksiko atau Inca. Ada pula yang mirip dengan bangsa Han, Tiongkok.