Pada 2023, Juan Villa kembali ke Amerika Latin untuk memperkuat CD America de Quito di Liga Pro Serie B Ekuador. Di klub tersebut dia tampil lebih produktif.
Juan Villa mencetak 10 gol dan lima assist dari 34 pertandingan. Performa tersebut membuatnya menjadi pemain penting di lini tengah tim.
Penampilan impresif itu membuat dia dipinjamkan ke Envigado FC di kasta tertinggi sepak bola Kolombia pada 2024. Dia tampil di Liga Dimayor Kolombia serta Copa Colombia sepanjang musim.
Kini, Juan Villa menjadi motor permainan Borneo FC di Super League 2025-2026. Kontribusinya membantu Pesut Etam menempati posisi kedua klasemen dengan 53 poin.
Borneo FC hanya terpaut empat poin dari Persib Bandung yang memimpin klasemen sementara Super League 2025-2026. Kedua tim bakal bentrok dalam laga tunda pada 15 Maret 2026 di Stadion Segiri, Samarinda.