Berdiri tahun 1964, Universitas Negeri Yogyakarta ini dulunya bernama IKIP Yogyakarta. Perguruan tinggi yang dikenal sebagai sekolah untuk para calon guru ini juga memiliki jurusan yang non pendidikan. UNY memiliki 8 fakultas yang terdiri dari Fakultas Ilmu Pendidikan, Bahasa dan Seni, MIPA, Ilmu Sosial, Ekonomi, Teknik, Ilmu Keolahragaan, hingga Program Pasca Sarjana.
3.Universitas Islam Negeri Sunan Kalijaga
Universitas yang berlokasi di perbatasan Jogja dengan Sleman ini berdiri pada tahun 1951. Memiliki 8 fakultas serta satu sekolah pascasarjana, salah satu universitas di Jogja ini masuk ke dalam daftar universitas terbaik di sini.