Gus Miftah berhasil mempersunting putri kiai bernama Ning Astuti. Dari pernikahan ini Gus Miftah dan Ning Astusi dikaruniai sepasang putra dan putri. Mereka yakni Atqiya Maulana Habiburrohman dan Mufti Nabil Ulayya Mecca.
Gus Miftah pernah berkuliah di UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta, tetapi tidak selesai di tahun keempat. Namun, karena merasa bahwa pendidikan itu wujud tanggung jawabnya kepada orangtuanya dan anak-anak yang mengidolakannyam ia melanjutkan studinya di Prodi Pendidikan Agama Islam, Fakultas Agama Islam, Universitas Islam Sultan Agung (Unissula) Semarang dan lulus pada Februari 2023 lalu.
Gus Miftah mengambil penelitian terkait pendidkan Islam berwasan kebangsaan dengan judul skripsinya “Pendidikan Islam Berwawasan Kebangsaan Berbasis Al Mizah dan AL Miftahiyyah”. Bahkan, Gus Miftah juga mendapat Letter of Acceptance untuk melanjutkan kuliah S2 di Unissula.
Semasa kuliah, Gus Miftah juga aktif di di organisasi kemahasiswaan seperti Pergerakan Mahasiswa Islam Indonesia (PMII) yang berfiliasi dengan Nahdlatul Ulama (NU).
Gus Miftah mulai berdakwah saat usianya baru menginjak 21 tahun atau sekitar tahun 2002. Awal kisahnya berdakwah adalah saat Gus Miftah sering sholat di mushala sekitar daerah Sarkem, atau area lokalisasi di kota Yogyakarta. Dengan niat berdakwah, Gus Miftah mulai rutin menggelar kajian agama di area lokalisasi tersebut.
Meski Gus Miftah mengakui bahwa tantangan pada awalnya, namun ia bersyukur karena jumlah pekerja di dunia malam itu mulai menerima kehadiran dirinya dan juga dakwahnya.