Selanjutnya pada tahun 2002, berdasarkan Undang-Undang Nomor 26 Tahun 2002 tentang Pembentukan Kabupaten di Provinsi Papua, wilayah Kabupaten Jayapura dimekarkan lagi menjadi 3 (tiga) Kabupaten yaitu Kabupaten Jayapura, Sarmi dan Keerom.
Potensi Daerah
Kota Jayapura setaraf dengan kota-kota besar lainnya di Indonesia. Banyak kendaraan berlalu-lalang dan tak jarang menyebabkan kemacetan panjang.
Selain itu juga di daerah ini banyak bangunan gedung berdiri dan menjadikan Jayapura sebagai dunia investasi bisnis serta perdagangan.
Salah satu yang kini terus dikembangkan yakni potensi pariwisata di Jayapura. Sebagai kota dengan sejarah yang luar biasa, Jayapura memiliki banyak daya tarik wisata untuk dikembangkan. Kota yang memiliki wilayah pegunungan sekaligus lautan ini terbentang seluas 940.000 hektare.