Papua dan Papua New Guinea bisa dibedakan berdasarkan bangsa barat yang menjajah kedua wilayah itu pada masa silam. Keduanya ternyata dijajah oleh sejumlah bangsa berbeda sehingga wilayahnya terpisah.
Keduanya memiliki sejarah kolonialisme berbeda. Papua dijajah oleh Belanda, sementara Papua New Guinea dijajah oleh Jerman, Inggris, hingga Australia.
Perbedaan selanjutnya bisa diselisik berdasarkan sistem pemerintahan. Sebagai salah satu provinsi di Indonesia, Papua mengikuti sistem pemerintahan Tanah Air yakni presidensial dengan bentuk republik.
Sementara sistem pemerintahan Papua New Guinea menganut asas monarki absolut alias kerajaan mutlak. Negara tetangga ini mengakui raja Inggris sebagai kepala negara, sementara pemimpin negara yaitu gubernur jenderal dengan kepala pemerintahan perdana menteri.