G30S/PKI ini juga terjadi di Yogyakarta, Komandan Resor Militer (Korem) 0772 Komando Daerah Militer (Kodam) VI Diponegoro di Yogyakarta, Kolonel Infantri Katamso Darmokusumo, dan Kepala Staf Korem 072 Letnan Kolonell Sugiono, diculik dan kemudian dibunuh.
Lokasi jenazah ditemukan oleh satuan Resimen Para Anggota Komando Angkatan Darat (RPKAD) di kawasan hutan karet Lubang Buaya. Para jenazah ditemukan di sumur tua yang kedalamannya kurang lebih 12 meter.
Untuk memulihkan situasi yang kacau, Soeharto yang saat itu berpangkat Mayor Jenderal dan menjadi Panglima Kostrad melakukan pemulihan dengan membubarkan PKI, yang dituduh sebagai dalang dari gerakan ini.
Maka, melalui Ketetapan (Tap) Majelis Permusyawaratan Rakyat Sementara (MPRS) Nomor XXV/MPRS/1966, PKI dinyatakan sebagai organisasi terlarang.
Awalnya, Hari Kesaktian Pancasila hanya diperingati oleh Tentara Negara Indonesia Angkatan Darat (TNI AD). Namun, terdapat perubahan dalam surat yang dikeluarkan oleh Menteri Utama Bidang Pertahanan Keamanan.