Habib Umar bin Hafidz juga memperoleh ijazah sanad Hadits dari Al-Musnid Syeikh Muhammad Yasin Al-Faddani dan Muhadditsul Haramain Sayyid Muhammad bin Alwi Al-Maliki serta sejumlah ulama lainnya.
Saat Habib Umar bin Hafidz berusia 9 tahun, ia menyaksikan ayahnya, Habib Muhammad bin Salim diculik oleh orang-orang komunis yang berkuasa di kawasan Yaman Selatan saat itu.
Ayahnya diculik lantaran sikapnya yang tegas dalam menyampaikan dakwah dan kebenaran dan keberadaannya tidak diketahui hingga kini.
Peristiwa itu merupakan titik balik bagi Habib Umar bin Hafidz dalam berdakwah, dia merasa perlu melanjutkan dakwah yang dilakukan ayahnya.
Pada usia 15 tahun, Habib Umar mulai mengajar dan berdakwah sambil belajar. Pada awal Desember 1981, Habib Unar pindah ke kota Baidha’, dan menetap di Ribath Al-Haddar. Habib Umar berguru kepada Habib Muhammad bin Abdullah Al-Haddar dan Habib Zain bin Ibrahim bin Sumaith.