Seperti halnya kebanyakan pengusaha sukses, William pun jatuh bangun dalam mendirikan Tokopedia. Ia terus mendatangi calon pemodal dan menyampaikan gagasan terkait marketplace besutannya.
Kemudian, pada 2009 akhirnya ia bisa memulai menjalankan Tokopedia dengan pemodal awal yakni, PT Indonusa Dwitama. Dalam membangun Tokopedia, ia mengajak rekannya Leontinus Alpha Edison pada 6 Februari 2009. Kemudian, pada 17 Agustus 2009, mereka meluncurkan Tokopedia dengan tujuan pemerataan ekonomi secara digital.
Seiring berjalannya waktu, pada 2010 Tokopedia mulai mendapatkan pendanaan dari banyak pihak seperti East Ventures, CyberAgent Venture, NetPrice, dan Softbank.
Pada 2014, Tokopedia juga mencatat rekor sebagai perusahaan di Asia Tenggara yang mendapat suntikan dana sebesar USD100 juta dari Sequoia Capital dan SoftBank Internet and Media Inc (SIMI).
Pada 17 Agustus 2017, Tokopedia berhasil meraih investasi senilai 1,1 miliar dolar AS atau sekitar Rp14 triliun dari Alibaba, e-commerce asal Cina milik Jack Ma.
Investasi tersebut menjadikan valuasi Tokopedia menembus 7 miliar dolar AS, sedikit di bawah unicorn Indonesia lainnya yaitu GoJek yang sebesar 9 miliar dolar AS.
Pada 2018, kekayaan William tercatat sebesar 130 juta dolar AS. Angka tersebut menurut data Globe Asia. Posisi William berada di atas pemimpin start up lainnya yakni Achmad Zaky yang merupakan CEO Bukalapak dengan kekayaan sebesar 105 juta dolar AS, dan Nadiem Makarim dari Gojek sebesar 100 juta dolar AS.