Elkan Baggott terakhir kali membela Timnas Indonesia pada babak 16 besar Piala Asia 2023. Saat itu, tim masih dilatih Shin Tae-yong sebelum terjadi pergantian pelatih.
Kini dia kembali menjadi bagian penting di lini pertahanan dalam era pelatih baru, John Herdman. Kehadiran Elkan menambah opsi bek yang bisa diandalkan tim.
Dalam FIFA Series 2026, dia tampil saat Timnas Indonesia menang 4-0 atas Saint Kitts and Nevis pada 27 Maret 2026. Namun, tim harus menerima kekalahan 0-1 dari Bulgaria pada 30 Maret 2026.
Kedua pertandingan tersebut berlangsung di Stadion Utama Gelora Bung Karno (SUGBK), Jakarta. Hasil tersebut membuat Timnas Indonesia finis sebagai runner-up dalam ajang FIFA Series 2026.
Setelah agenda internasional selesai, seluruh pemain Timnas Indonesia kembali ke klub masing-masing. Kompetisi domestik maupun luar negeri kembali berjalan setelah jeda internasional.
Elkan Baggott juga kembali melanjutkan kariernya di level klub. Namun, momen unggahan jersey Timnas Indonesia menjadi sinyal kuat kebanggaan dan komitmennya bersama skuad Garuda.
Unggahan tersebut sekaligus menandai babak baru perjalanan Elkan bersama Timnas Indonesia. Dukungan dari rekan setim dan publik menjadi dorongan tambahan untuk tampil lebih konsisten ke depan.