Memasuki babak kedua, PSBS Biak tampil lebih agresif demi mengejar ketertinggalan, namun penyelesaian akhir mereka belum membuahkan hasil.
PSM Makassar justru mampu menggandakan keunggulan pada menit ke-53 lewat gol Gledson Silva yang memanfaatkan kelengahan lini belakang PSBS Biak.
Tekanan terus dilancarkan PSBS Biak dan usaha tersebut membuahkan hasil pada menit ke-79 ketika Ruyery Blanco memperkecil kedudukan menjadi 1-2.
Situasi semakin sulit bagi PSBS Biak setelah Heri Susanto diganjar kartu merah di akhir babak kedua, membuat tim harus bermain dengan 10 pemain.
PSM Makassar mampu menjaga keunggulan hingga peluit panjang dibunyikan dan mengamankan tiga poin penting atas Badai Pasifik.
PSBS Biak (4-2-3-1): Kadu; Hadi Ardiansyah, Arif Budiyono, Sandro Embalo, Pablo Andrade; Damianus Putra, Eduardo Barbosa; Heri Susanto, Luquinhas, Ruyery Blanco; Mohcine Hassan.
Pelatih: Agus Sugeng Riyanto.
PSM Makassar (4-4-2): Reza Arya Pratama; Syahrul Lasinari, Alosio Neto, Yuran Fernandes, Victor Luiz; Jacques Medina, Resky Fandi, Gledson Silva, Rizky Eka Pratama; Alex Tanque, Fahrul Aditia.
Pelatih: Tomas Trucha.