2. Sri Sultan Hamengku Buwono II (1792-1828)
Sri Sultan Hamengku Buwono II merupakan putra dari Sri Sultan Hamengku Buwono I dari permaisuri kedua. Sri Sultan Hamengku Buwono II lahir dengan nama RM Sundoro dan dinobatkan sebagai putra mahkota pada 1758.
Pada tahun 1810 Sri Sultan Hamengku Buwono II dipaksa turun takhta oleh Belanda dan digantikan oleh putranya yang bergelar Sri Sultan Hamengku III. Ketika Inggris datang pada 1811, Sri Sultan Hamengku Buwono II mengambil takhtanya kembali dari sang putra.
Namun pada 1812, akibat peristiwa Geger Sepehi Sri Sultan Hamengku Buwono II ditangkap dan diasingkan oleh Inggris ke Pulau Pinang. Sri Sultan Hamengku Buwono II sempat kembali ke Jawa pada 1815, tetapi peralihan kekuasaan kembali ke Belanda yang membuatnya diasingkan kembali di Ambon.
Pada 1826, ia dipulangkan ke Jawa dan diangkat untuk ketiga kalinya menjadi Sultan Yogyakarta.
3. Sri Sultan Hamengku Buwono III (1810-1814)
Sri Sultan Hamengku Buwono III lahir dengan nama Raden Mas Surojo pada 20 Februari 1769. RM Surojo adalah putra Sri Sultan Hamengku Buwono II dan Gusti Kanjeng Ratu Kedhaton. Sri Sultan Hamengku Buwono III naik takhta ketika Sri Sultan Hamengku Buwono II dilengserkan oleh Belanda pada 1810.
4. Sri Sultan Hamengku Buwono IV (1814-1822)
Sri Sultan Hamengku Buwono IV adalah putra dari Sri Sultan Hamengku Buwono III dengan Permaisuri Gusti Kanjeng Ratu Hageng yang lahir dengan nama Gusti Raden Mas Ibnu Jarot. GRM Ibnu Jarot naik takhta pada 1814 ketika usianya baru 10 tahun, sehingga pemerintahannya didampingi oleh Paku Alam I sebagai wali raja.
5. Sri Sultan Hamengku Buwono V (1823-1855)
Sri Sultan Hamengku Buwono V adalah putra dari Sri Sultan Hamengku Buwono IV dan Gusti Kanjeng Ratu Kencono yang lahir dengan nama Gusti Raden Mas Gatot Menol. Ketika sang ayah wafat, GRM Gatot Menol yang baru berusia 3 tahun diangkat sebagai Sultan Yogyakarta. Karena usianya masih belia, pemerintahan dijalankan oleh dewan perwalian hingga usianya dewasa.