Melalui karya-karya dan kontribusi pemikirannya, pada 2008 Buya Syafii dianugerahi penghargaan Ramon Magsaysay dari Pemerintah Filipina. Sebelumnya, Buya juga pernah memimpin salah satu organisasi Islam terbesar di Indonesia yaitu Muhammadiyah dengan ditunjuk sebagai Ketua Umum PP Muhammadiyah dari 2000 hingga 2005.
Sementara pada 2017, Buya Syafii dilantik sebagai Dewan Pengarah BPIP RI yang saat itu masih bernama Unit Kerja Presiden (UKP) Pembinaan Ideologi Pancasila. Melalui BPIP, Buya selalu menyumbangkan pemikiran-pemikirannya, baik melalui tulisan hingga diskusi bersama dengan para Dewan Pengarah BPIP lain.