2. SMAS Muhammadiyah Boarding School (MBS)
5 SMA swasta terbaik di Sleman kedua adalah SMAS MBS yang berada di peringkat 388 nasional dengan nilai 539,441. Sedangkan di wilayah DIY berada di peringkat 37 dan 11 untuk Kabupaten Sleman.
SMAS MBS terletak di Bokoharjo Kecamatan Prambanan, Sleman. Sejarah awal pendirian MBS tidak terlepas dari adanya keprihatinan para kader muda Muhammadiyah yang merasakan betapa minimnya generasi kader persyarikatan diwilayah Prambanan dan sekitarnya. Sekolah ini didirikan pada 20 Januari 2008.
3.SMA Budi Mulia II
5 Sekolah swasta di Sleman selanjutnya ada SMA Budi Mulia II. Sekolah yang terletak di Wedomartani, Ngemplak. Sleman. Sekolah ini berada di peringkat 474 nasional dengan nilai 533,705. Sedangkan untuk di DIY di peringkat 48 dan 13 di Sleman.
Sekolah ini didirikan Amien Rais paa 1987 dengan menggunakan kurikulum nasional dan Islam. Sekolah ini mendidik siswa agar memiliki keimanan dan ketakwaan serta berintegritas dan hubungan sosial dengan lingkungan yang baik.
4. SMA IT Baitusalam
5 SMA Swasta Terbaik di Sleman selanjutnya ada SMA IT Baitusalam. Sekolah ini terletak di Bokoharjo, Prambanan dan berada di peringkat 634 nasional dan 57 untuk DIY. Sedangkan di Sleman berada di peringkat 15.
SMA IT Baitusalam mberbasis pendidikan Islam dengan menggabungkan kurikulum nasional, Gontor dan jaringan Islam Terpadu. Seluruh siswa wajib tinggal di Asrama.