Ada tiga spesies yang tercatat berada di Indonesia, yaitu orang utan Kalimantan (Pongo pygmaeus), orang utan Kalimantan (Pongo pygmaeus) dan orang utan Tapanuli (Pongo tapanuliensis).
Orang utan mengalami penurunan populasi akibat perburuan liar dan kerusakan habitat. Banyak hutan habitat satwa ini menjadi kebun kelapa sawit. BPS menyatakan jumlah orang utan pada 2017 sebanyak 1.890 ekor. Mengalami kenaikan dibandingkan tahun 2015 sebanyak 143 ekor saja.
Perut buncit, rambut cokelat kemerahan serta hidung besar yang panjang menjadi ciri khas satwa asli Pulau Borneo ini. Bekantan (Nasalis Larvatus) menjadi maskot provinsi Kalimantan Selatan.
Bekantan dikategorikan sebagai hewan dengan status konservasi “terancam” oleh International Union for Conservation of Nature (IUCN) Redlist. BPS mencatat populasi Bekantan pada 2017 sebanyak 1.365 ekor.
Merupakan satwa endemik Indonesia yang menempati Taman Nasional Komodo, Nusa Tenggara Timur. Komodo diklaim sebagai kadal terbesar dan tertinggi di dunia.