Bukan tanpa alasan Pangeran Pekik ditunjuk memimpin serangan. Dia merupakan keturunan Sunan Ampel, salah satu Walisongo.
Sebagaimana diketahui Sunan Kawis Guwa merupakan keturunan Sunan Giri I. Sedangkan Sunan Giri I adalah murid dari Sunan Ampel.
Posisi itu membuat status sosial maupun keagamaan Pangeran Pekik lebih tinggi ketimbanga Sunan Kawis Guwa.
Inilah yang membuat semangat pasukan Mataram Islam bangkit hingga memenangkan peperangan melawan Giri Kedaton.
Pada 1636, Giri Kedaton akhirnya takluk terhadap Mataram Islam. Sunan Kawis Guwa tetap bisa memimpin Giri Kedaton dengan syarat tunduk kepada Mataram Islam.