Akan tetapi, saat ini hanya tersisa kompleks bangunan yang berpintukan Labang Mesem dan tetap berdiri kokoh hingga kini.
Adapun secara fisik keraton di Sumenep berbeda dengan bangunan keraton di Solo maupun Yogyakarta. Secara luas, Keraton Sumenep kalah dengan bangunan Kesultanan Ngayogyakarta Hadiningrat dan Kesunanan Surakarta Hadiningrat.
Pasalnya pada hakikatnya keraton di Sumenep hanya rumah tinggal raja dan anggota keluarganya. Secara strtata, Sumenep menjadi bawahan Mataram dengan penguasa yang bergelar adipati.
Hanya saja rakyat tetap menyebut adipati tersebut sebagai rato atau raja. Terlebih campur tangan Belanda saat itu yang menyetarakan Keraton Sumenep dengan Solo dan Yogyakarta demi kepentingan politik.