Tak hanya menangkapnya, beberapa tokoh ulama dan santri serta pemuda muslim juga ditangkap sang residen Belanda, saat tengah belajar agama Islam. Para santri dan pemuda ini bahkan dapat dijatuhi hukuman mati, hanya karena diduga sebagai simpatisan pro Diponegoro.
Rangkaian peristiwa inilah yang membuat hubungan Diponegoro dengan pemerintah kolonial Belanda kian memburuk. Apalagi Diponegoro sempat diasingkan selama enam tahun 1816 - 1824 dan kematian Kiai Murmo di pengasingan, kian menguncang jiwanya dan menumbuhkan keyakinan diri pada Pangeran Diponegoro, bahwa para pejabat jenis baru Belanda dan para penyewa tanah betul-betul kurang menghormati Islam.