Di Kebun Raya ini terdapat sejumlah taman yang layak dikunjungi. Berikut taman-taman di dalam Kebun Raya Bogor:
- Taman Durian
Taman Durian merupakan taman konservasi binaan Pertamina yang berada di wilayah Kebun Raya Bogor. Pertamina melalui Taman Durian ini berupaya untuk memperkenalkan berbagai macam durian asli Indonesia. Jenis durian yang ditanam di Taman Durian ini, salah satunya adalah Durian Lai Mas dari Kalimantan.
- Taman Anggrek Hitam
Taman Anggrek Hitam merupakan taman konservasi binaan Pertamina di Kebun Raya Bogor. Pertamina telah melakukan konservasi beberapa jenis tanaman Anggrek Hitam, antara lain, Coelogyne pandurata, Grammatophyllum speciosum, Grammatophyllym stapeliiflorum, dan Grammatophyllum scriptum.
- Monumen Lady Raffles
Tugu Lady Raffles terletak tidak jauh dari pintu utara Kebun Raya Bogor. Tugu ini memiliki denah lingkaran yang menyerupai sebuah gazebo atau bangunan terbuka dengan delapan pilar.
Di bagian tengah terdapat prasasti persegi dengan ornamen berbentuk cawan di atasnya. Pada tugu tersebut terdapat kata-kata puitis dalam bahasa Inggris klasik yang merupakan hasil karya Olivia Madamne atau Lady Raffles.