Saat Megawati menjabat sebagai Presiden, pernah dilakukan penggalian harta karun di Batutulis Bogor. Megawati menujuk langsung Menteri Agama (Menag) Said Agil Husin Al Munawar pada Agustus 2002 untuk memimpin langsung pencarian harta karun tersebut.
Menag saat itu mengaku mendapat mimpi atas peninggalan harta karun tersebut. Ada seseorang yang datang kepadanya menyebutkan di bawah tanah wilayah Batu Tulis terkubur harta karun peninggalan Prabu Siliwangi. Nilainya diperkirakan cukup untuk membayar utang negara.
Namun setelah dilakukan penggalian, tidak ada harta karun yang ditemukan. Ketika proses penggalian dilakukan juga terjadi angin kencang di sekitar wilayah tersebut.
Tak hanya itu, penggalian tersebut juga sempat menuai protes dari warga. Said Agil saat itu akhirnya meminta penggalian harta karun di Batu Tulis, Bogor, ditutup karena terlalu banyak orang yang menyebarkan lebih dulu. Selain itu, ada pihak-pihak yang tidak ikhlas memberikannya kepada negara. Namun, dia tidak menyebutkan identitas orang tersebut.