Kurang dari 10 tahun kemudian, dia menjadi presiden menyusul pembunuhan yang terjadi pada pendahulunya, Presiden Anwar Sadat. Dia juga memainkan peran kunci dalam proses perdamaian Israel-Palestina.
Di tengah miliaran dolar bantuan militer yang diterima Mesir selagi dia berkuasa, pengangguran, kemiskinan, dan korupsi terus tumbuh di Mesir.
Ketidakpuasan memburuk pada Januari 2011 sesudah ada protes sejenis sebelumnya di Tunisia yang berhasil menjatuhkan presiden. Mubarak kemudian dijatuhkan 18 hari kemudian.
Hosni Mubarak berlatar belakang militer, tetapi dia memegang komitmen negaranya akan perdamaian internasional.
Di bawah kepemimpinannya, Mesir memainkan peran utama menjadi perantara perjanjian damai antara Israel dan Palestina.