Terkait dengan misi Kota Nusantara sebagai kota dunia yang menetapkan diri sebagai Kota Hutan Berkelanjutan, maka pembangunannya akan berfokus pada perlindungan hutan dan konservasi yang dikawal dengan perangkat aturan dan perencanaan penggunaan tanah.
Hal ini penting untuk memastikan bahwa area hutan akan dikonservasi, dan akan ada taman perkotaan, area hijau untuk umum serta kualitas udara yang sangat baik. Nusantara merencanakan program-program pengurangan dampak cuaca panas di perkotaan dan memberikan tempat rekreasi untuk warga setempat serta tidak akan mengijinkan perusakan hutan serta akan mempertahankan keanekaragaman hayati.
Bagian dari pelaksanaan tujuan ini adalah kontruksi gedung dengan prinsip hijau yang memperhatikan efisiensi energi, penggunaan material ramah lingkungan dan menerapkan desain dengan prinsip-prinsip hijau semisal pencahayaan alami, pemanfaatan air hujan serta atap dengan prinsip hijau.