Memasuki babak kedua, Mozambik tampil lebih berani dengan menaikkan garis pertahanan. Perubahan itu membuat Indonesia tidak lagi leluasa membangun serangan seperti pada paruh pertama.
Pada menit ke-57, Ragnar Oratmangoen menerima umpan terobosan lambung dari Rizky Ridho. Namun, Ragnar yang mendapat kawalan ketat gagal menjangkau bola di area berbahaya.
Mozambik meningkatkan intensitas serangan dengan mengandalkan umpan terobosan ke belakang lini pertahanan Tim Merah Putih. Beberapa kali lini belakang Indonesia dipaksa bekerja ekstra untuk menjaga keunggulan.
Peluang emas Indonesia kembali hadir pada menit ke-67. Tendangan Nathan Tjoe-A-On hasil umpan silang Rayhan Hannan membentur mistar gawang, lalu bola rebound disambar dengan tembakan jarak jauh yang belum menemui sasaran.
Tekanan Mozambik makin terasa pada pertengahan babak kedua. Alcidio Davide melepaskan tembakan keras pada menit ke-70 yang melayang di atas gawang Maarten Paes, lalu disusul peluang Bheu Antonio yang memaksa Paes melakukan penyelamatan penting pada menit ke-73.