Namun setelah turnamen itu, dia tidak lagi masuk daftar pemain tim nasional. Situasi tersebut sempat dikaitkan dengan hubungan yang tidak harmonis antara Elkan dan pelatih Shin Tae-yong.
Sejak periode itu, nama Elkan Baggott tidak pernah muncul dalam daftar panggilan tim nasional hingga pergantian pelatih kepala. Timnas Indonesia kemudian memasuki era baru setelah kursi pelatih dipegang Patrick Kluivert.
Kini peluang kembali terbuka untuk bek bertubuh jangkung tersebut. Di era kepelatihan John Herdman, dia kembali dipercaya memperkuat lini belakang Timnas Indonesia.
Momentum ini menjadi kesempatan penting bagi Elkan untuk kembali menunjukkan kualitasnya bersama Skuad Garuda.
Sampai saat ini, PSSI belum merilis daftar lengkap pemain Timnas Indonesia untuk FIFA Series 2026. Namun sejumlah pemain diaspora diprediksi tetap menjadi bagian penting skuad.