Piala Eropa 1996 pun menjadi ajang bergengsi untuk Khan. Jerman pun berhasil keluar sebagai juara, setelah mengalahkan Republik Ceko dengan skor 2-1.
Namun pada Piala Eropa 2000, Kahn dan kolega tak mampu lolos pada fase grup dan menjadi juru kunci di Grup A dengan berhasil meraih satu poin dalam tiga pertandingan. Der Panzer pun gagal mempertahankan gelar Piala Eropa.
Usai gagal di Piala Eropa 2000, Jerman mencoba bangkit di Piala Dunia 2002. Ketika itu, Kahn tampil dengan sangat baik dengan hanya kebobolan satu gol.
Alhasil, Jerman diunggulkan untuk menjadi juara Piala Dunia 2002. Namun di partai puncak Khan dan kawan-kawan harus menghadapi Brasil yang berisikan nama-nama seperti Ronaldo de Lima, Roberto Carlos, Juninho, Cafu, Rivaldo, dan Ronaldinho.
Pada babak pertama, Khan berhasil menunjukkan penampilan apik dengan menggagalkan serangan yang dibuat oleh Brasil. Akan tetapi di babak kedua, ia harus kemasukan gol yang dicetak oleh Ronaldo de Lima dan membuat Brasil keluar sebagai juara.