Setelah pensiun sebagai pemain, Riono melanjutkan perjalanan di dunia sepak bola sebagai pelatih. Dia dipercaya menjadi pelatih kepala Persebaya Surabaya pada musim Liga Indonesia 1999. Penunjukan tersebut menjadi awal kiprahnya sebagai pelatih profesional di kompetisi nasional.
Karier kepelatihannya kemudian berlanjut ke sejumlah klub. Riono pernah melatih Persiku Kudus dalam dua periode berbeda, yaitu pada 2011–2012 dan kembali pada 2015. Di klub tersebut, dia dikenal memiliki kemampuan membangun tim yang kompetitif.
Selain Persiku, Riono juga pernah menangani Deltras Sidoarjo. Dia menerapkan pendekatan taktik yang menekankan disiplin permainan dan serangan balik untuk menghadapi lawan. Pendekatan ini menjadi ciri khas filosofi kepelatihannya.
Riono juga tercatat pernah melatih Persiba Balikpapan pada 2006. Namanya bahkan sempat masuk dalam bursa kandidat pelatih sejumlah klub lain di Liga Indonesia, termasuk Persijap Jepara dan beberapa tim kompetisi nasional.