Hal itu membuatnya terancam hukuman skors tampil di ajang internasional selama dua tahun. Insiden itu juga membuat Lee Chong Wei sempat memutuskan ingin gantung raket dan berhenti total dari badminton.
Namun, pada April 2015, BWF akhirnya mengeluarkan keputusan hukuman larangan bertanding yang diberikan hanya delapan bulan. Namun, ia dipaksa mengembalikan medali perak yang pernah diperoleh dalam World Championships.
Setelah hukuman berakhir, Lee langsung kembali memainkan raketnya dan tampil di Piala Sudirman 2015 dengan sangat gemilang. Ia tampil tanpa terkalahkan sepanjang turnamen kecuali di partai final saat bersua wakil Korea Selatan.
Pada 13 Juni 2019, Lee mengumumkan pengunduran dirinya setelah berjuang untuk kembali bugar sepenuhnya menyusul diagnosis kanker hidung. Keputusan pensiun tersebut datang dari sang dokter demi pertimbangan kesehatannya.