Peristiwa tersebut dimungkinkan karena sungai bawah tanah yang bermuara di Pantai Baron tengah banjir usai diguyur hujan deras selama empat hari. Akibatnya air sungai bawah tanah yang masuk ke Pantai Baron berwarna keruh kecokelatan.
Muara sungai bawah tanah di Pantai Baron juga berada di bawah tebing pantai Baron, tepat di bawah dermaga yang ada. Sehingga air keruh tersebut masih ke dalam laut dari kedalaman dan tidak bisa langsung bercampur karena kemungkinan perbedaan berat jenis.
Seperti diberitakan sebelumnya, sungai bawah tanah di Kabupaten Gunungkidul meluap seperti di Goa Seropan dan juga Bribin. Air sungai bawah tanah bahkan memenuhi mulut goa yang semi vertikal. Akibat luapan sungai bawah tanah tersebut, pasokan air bersih di delapan Kapanewon dari PDAM sempat lumpuh.