Toni merupakan lulusan Akademi Kepolisian (Akpol) 1988. Dia dikenal berpengalaman dalam bidang reserse. Sejumlah jabatannya terkait bidang ini di antaranya Karobinopsnal Bareskrim Polri pada 2016 dan Wadirtipidum Bareskrim Polri pada 2013 dan pada 2007 sebagai Wadir Reskrimsus Polda Metro Jaya.
Selain itu, jauh sebelumnya dia pernah menjabat Kasat IV Dit Reskrimsus Polda Metro Jaya pada 2002 dan pada 2003 Kasat IV/Cyber Crime Dit Reskrimsus Polda Metro Jaya.
Sebelum menjabat Kapolda Sumbar, Toni Harmanto pernah menjabat Widyaiswara Utama Sespim Lemdiklat Polri. Dia juga menjabat Wakapolda Jawa Timur (Jatim).
Dia pernah pula menjabat Wadir Reskrimsus Polda Metro Jaya dan Penyidik Utama Tk III Dit I/Kam Dan Trannas Bareskrim Polri.
Sebelumnya, Kapolri Jenderal Pol Listyo Sigit Prabowo kembali melakukan mutasi. Dari 98 pejabat tinggi (pati) dan pejabat menengah (pamen) yang dimutasi, salah satunya Kapolda Sumsel Irjen Pol Eko Indra Heri.
Irjen Pol Eko Indra Heri diangkat dalam jabatan baru sebagai Koorsahli Kapolri. Sementara Kapolda Sumsel kini dijabat Irjen Pol Toni Harmanto yang sebelumnya menjabat Kapolda Sumbar. Selanjutnya Kapolda Sumbar dijabat Irjen Pol Teddy Minahasa Putra.