Pada tahun tersebut, Joni Botak bergabung bersama KKB pimpinan Lekagak Telenggen. Mereka membakar gedung Gereja Kemah Injil Indonesia (GKII) Jemaat Sinai, Kampung Opitawak, Distrik Tembagapura pada 12 Maret 2020. Selain itu juga tercatat pernah menembak warga sipil di Tembagapura yang dianggap mata-mata.
Kapolda Papua Irjen Pol Mathius Fakhiri membenarkan laporan tentang tewasnya Joni Botak, pimpinan KKB di wilayah Tembagapura-Intan Jaya, Papua Tengah.
"Joni Botak ditangkap, dianiaya dan ditembak kelompok KKB lainnya Senin (24/4) di Intan Jaya karena dituduh mata-mata," ujar Kapolda, Sabtu (29/4/2023).
Bahkan video eksekusinya beredar di media sosial dalam sepekan terakhgir. Dalam video tersebut, Joni Botak dianiaya dan ditembak, termasuk dua orang anak buahnya.