Kemudian perjalanan dilanjutkan lagi menuju Kantor Wali Kota Jayapura sebagai perhentian kedua dari Kirab Api.
Setelah satu jam perjalanan dari Kompleks Olahraga Lukas Enembe, rombongan Kirab Api tiba di dekat Kantor Wali Kota Jayapura. Sekitar 500 meter menjelang tempat berkantornya Wali Kota Benhur Tomi Mano.
Lalu peserta kirab turun dari kendaraan mereka menuju kantor wali kota. Mereka mengarak obor hingga memasuki halaman kantor dan disambut Benhur Tomi Mano.
Api diinapkan selama semalam dan akan kembali diarak menuju Kantor Gubernur. Api akan disulut ke kaldron di Stadion Mandala, Kota Jayapura pada upacara pembukaan Peparnas XVI Papua oleh Wakil Presiden Ma'ruf Amin, Jumat (5/11/2021).