Syekh Ali Jaber juga menikahi seorang perempuan asal Lombok bernama Umi Nadia. Pasangan ini memiliki seorang anak yang diberinama Hasan.
Pendakwah kelahiran Madinah ini meninggal dunia di Jakarta pada Kamis pagi. Almarhum sempat dinyatakan positif Covid-19, namun sudah dinyatakan negatif corona sebelum meninggal dunia.