Selanjutnya saat berpangkat jenderal bintang satu, Saleh menjabat sebagai Kasdam Jayakarta mendampingi KSAD Jenderal Dudung Abdurachman yang ketika itu berpangkat Mayjen sebagai Pangdam Jaya.
Pada Agustus 2022, Mayjen TNI Muhammad Saleh Mustafa dipromosikan menjabat Pangdam XVII Cenderawasih menggantikan Mayjen TNI Teguh Muji Angkasa.
Setahun kemudian, tepatnya 15 Agustus 2023, Mayjen TNI Saleh Mustafa menjabat Kaskostrad.
Waasops Danjen Kopassus
Dan Grup 1 Kopassus (2012-2013)
Asops Kasdam Iskandar Muda (2013-2015)
Pasis Sesko TNI (2015-2016)
Pamen Ahli Kopassus Bidang Pendidikan dan Latihan (2016)
Danrem 132/Tadulako (2016-2017)
Wadan Pussenif Kodiklat TNI-AD (2017-2019)
Kasdam Jayakarta (2019-2021)
Kaskogabwilhan II (2021-2022)
Pangdam XVII/Cenderawasih (2022)
Kaskostrad (2023)