Pada Natal 2021 dan Tahun Baru 2022, pihaknya juga melakukan Siaga SAR Khusus. Hal ini dimulai sejak 14 Desember 2021 hingga 4 Januari 2022.
Pelaksanaan Siaga SAR khusus dilakukan di beberapa posko utama di Kota Ambon seperti Bandar Udara Internasional Pattimura, Pelabuhan Yos Sudarso, Pelabuhan Slamet Riyadi, dan beberapa tempat-tempat wisata di Ambon.
Basarnas Ambon menyatakan semua operasi ini terlaksana dengan lancar dan aman. Sepanjang Siaga SAR khusus Natal dan Tahun Baru, tim SAR berhasil menangani tiga laporan musibah yang terjadi di Namlea, Maluku Tengah, dan Seram Bagian Timur.