Asal-usul Sungai Mahakam juga dapat ditilik dari namanya. Nama Mahakam merupakan penyederhanaan kata Muara Kaman.
Muara Kaman merupakan nama salah satu lokasi kekuasaan Kerajaan Kutai Martapura. Wilayah itu juga menjadi pusat kerajaan bercorak Hindu tersebut.
Muara Kaman juga merupakan penyederhanaan dari kata Mulawarman, salah satu raja di Kerajaan Kutai Martapura.
Sementara versi lain menyebutkan, Mahakam merupakan gabungan dari kata "maha" berarti tinggi atau besar, dan "makam" yang artinya kuburan.
Maka, secara harfiah, Mahakam bermakna kuburan yang tinggi atau besar.
Demikian asal-usul Sungai Mahakam. Salah satu sungai terbesar di Indonesia ini berperan besar dalam perkembangan Kaltim hingga seperti saat ini.