Selain itu, Singkawang juga memiliki penduduk dari berbagai suku dan etnis seperti Jawa, Sumatera, Madura, Ambon, dan Sulawesi.
2. Manado
Posisi ketiga ditempati Manado dengan skor IKT 6,200. Posisi ini naik satu peringkat dari tahun 2018. Tak hanya diakui oleh Setara Institute, Manado juga mendapatkan penghargaan dari Sindo Weekly Government Award sebagai kota paling toleran.
Pemerintah Kota Manado sangat menjunjung rasa toleransi dan kerukunan yang tegas. Hal ini dapat dilihat dari RPJMP Kota Manado 2016-2021 yang telah memuat secara dominan mengenai penguatan toleransi dan kerukunan umat beragama pada visi, misi, tujuan hingga strategi serta arah kebijakannya.
3. Tomohon
Kota Tomohon merupakan daerah hasil pemekaran Kabupaten Minahasa. Kota yang dijuluki Kota Bunga ini menempati posisi ke-4 sebagai kota toleran dengan skor 6,183. Hal ini membuat Kota Tomohon naik 4 peringkat dari urutan ke-8 pada IKT 2018.
Pencapaian ini membuktikan Kota Tomohon senantiasa meningkatkan kualitas toleransinya.