- Pandeglang (Banten) - tepatnya di sekitar Teluk Lada, dipercaya sebagai pusat pemerintahan.
- Condet (Jakarta Timur) - dianggap punya sisa-sisa jejak budaya tua.
- Lereng Gunung Salak (Bogor, Jawa Barat) - diduga menjadi lokasi strategis kerajaan zaman kuno.
Namun sampai saat ini belum ada bukti arkeologis yang secara langsung mengonfirmasi keberadaan pusat kekuasaan kerajaan di tiga wilayah tersebut.
Meski isi Naskah Wangsakerta cukup lengkap dalam menjelaskan struktur dan wilayah Kerajaan Salakanagara, keberadaannya masih diperdebatkan oleh sejarawan.
Naskah ini diklaim dikerjakan selama 21 tahun oleh panitia riset Kesultanan Cirebon dan rampung pada tahun 1698 Masehi. Namun, karena tidak ada sumber pembanding kuat serta minimnya verifikasi ilmiah, banyak akademisi meragukan keotentikannya.
Kerajaan Salakanagara masih menjadi bagian dari teka-teki sejarah Nusantara. Benarkah kerajaan ini lebih tua dari Kutai? Hingga kini, jawaban itu masih menggantung dan menunggu bukti lebih konkrit.