AR Baswedan tutup usia pada 16 Maret 1986, yakni pada usia 77 tahun di rumahnya Jalan Taman Yuwono, Yogyakarta. Pada 8 November 2018, Presiden Joko Widodo (Jokowi) di Istana Kepresidenan Jakarta menganugerahi AR Baswedan dengan gelar Pahlawan Nasional.