Pemakamannya berada di tengah-tengah permukiman desa, dengan dikelilingi tembok tebal berwarna putih. Konon di situs inilah tempat tinggal Sunan Bonang hingga beliau wafat dan dimakamkan di sana.
Lokasi makam Sunan Bonang di Lasem ini berbeda dengan dua lokasi sebelumnya yang memiliki cungkup atau tutup makam. Di sini makam Sunan Bonang tak memiliki cungkup, konon beberapa kali usaha membuatkan cungkup selalu gagal oleh hal-hal yang tak masuk akal.
Perihal mengenai kenapa tidak digunakan cungkup sang juru kunci makam menyebut itu bagian dari agar menyimpan rahasia. Selain itu sang waliullah ini konon sempat memberikan wasiat yang mengikuti Sunan Ampel.
Dia meminta agar makamnya tidak dipsang cungkup untuk menghindari pengkultusan makamnya.