Puncak karier Djoko Santoso ketika menjabat Kepala Staf TNI Angkatan Darat pada 2005–2007. Sebelum pensiun, dia menjadi Panglima TNI hingga tahun 2010.
Selama berdinas di militer sejak 1975 hingga 2010, Ketua Dewan Pembina Gerakan Indonesia ASA (Adil, Sejahtera, Aman) ini mendapatkan berbagai bintang jasa, baik dalam negeri namun luar negeri. Bintang jasa pertama Djoko Santoso di dalam negeri yaitu Satyalancana Seroja.
Bintang jasa itu diberikan sebagai bentuk penghormatan pemerintah atas jasa anggota TNI/Polri dalam menanggulangi masalah keamanan oleh gerombolan pengacau dari luar batas negara di wilayah Nusa Tenggara Timur (NTT).
Berikut sederet Bintang Jasa Djoko Santoso:
Dalam negeri
Satyalancana Seroja
Satyalancana Kesetiaan XXIV Tahun
Bintang Yudha Dharma Pratama
Bintang Kartika Eka Paksi Pratama
Bintang Yudha Dharma Nararya
Bintang Dharma
Bintang Kartika Eka Paksi Nararya
Bintang Bhayangkara Utama
Bintang Kartika Eka Paksi Utama
Bintang Mahaputra Adipradana
Luar negeri
Pingat Jasa Gemilang (Singapura)
The Knight Grand Cross of The Most Noble Order of The Crown of Thailand, Distinguished Service Order (Thailand)
Darjah Paduka Keberanian Laila Terbilang Yang Amat Gemilang Darjah Pertama (Brunei)
Pahlawan Gagah Angkatan Tentera (Malaysia)
Seusai pensiun dan meninggalkan karier militer, Djoko menggeluti dunia politik. Dia memilih bergabung dengan Partai Gerindra dengan menjabat sebagai Wakil Ketua Dewan Pembina.