Penyebab runtuhnya Kerajaan Demak cukup beragam. Menuju keruntuhan, pemerintah dianggap gagal karena terdapat banyak perbedaan mazhab antara masyarakat dan bangsawan yang membuat rakyat merasa tidak didengar aspirasinya.
Konflik semakin diperparah dengan adanya perebutan kekuasaan. Hal itu bermula ketika Adipati Unus tidak memiliki anak laki-laki, sedangkan Raden Patah mempunyai banyak anak lelaki dari istri yang berbeda-beda.
Perebutan takhta semakin menjadi-jadi ketika keturunan Raden Patah saling membunuh. Arya Penangsang tercatat pernah menghabisi nyawa Sunan Prawoto sekeluarga untuk membalaskan dendam sang ayah.
Sebagaimana yang telah diketahui, Arya Penangsang merupakan putra dari Sekar Seda Lepen. Sementara itu, Sekar Seda Lepen sempat dibunuh oleh Sunan Prawoto karena dianggap menentang kekuasaannya di Kerajaan Demak.
Kerajaan Demak memiliki beberapa peninggalan bersejarah yang ditemukan pada masa sekarang. Beberapa peninggalan tersebut adalah Masjid Agung Demak dan Makam Sunan Kalijaga.