Rifky Alaydrus memiliki sebutan ‘Habib’ di depan namanya karena merupakan keturunan Nabi Muhammad. Hal itu dapat dilihat dari marganya, ‘Alaydrus’, yang merupakan cucu dari marga Assegaf.
Ayahnya, KH Habib Syarif Muhammad Al Aydrus, juga merupakan seorang Habib sekaligus tokoh Nahdlatul Ulama (NU) terkenal di Jawa Barat. Karenanya, ia lahir dan tumbuh sebagai seorang muslim yang religius.
Habib Rifky Alaydrus diketahui telah menikah dengan seorang wanita keturunan Nabi Muhammad SAW atau biasa disebut ‘Syarifah’ pada 19 Agustus 2015. Istrinya itu bernama Rizka Farradiba Shahab.
Dari pernikahan tersebut, Habib Rifky Alaydrus dan Syarifah Rizka Farradiba Shahab telah dikaruniai seorang anak bernama Faqih Alaydrus. Berbeda dari dirinya, putra semata wayangnya itu justru telah menjadi artis cilik dengan membintangi sejumlah sinetron dan film serta menjadi model iklan.
Memiliki ayah yang merupakan tokoh agama membuat Habib Rifky Alaydrus berada di lingkungan yang agamis. Ia lalu menjadi pendakwah saat beranjak dewasa.