Di bagian utama masjid terdapat pintu masuk kecil. Saat jemaah masuk harus menundukkan kepala. Hal tersebut sebagai penghormatan dan makna merendahkan diri saat masuk masjid.
Selain itu pintu kecil di gerbang masjid bermakna semua manusia memiliki kedudukan sama di mata Sang Pencipta sehingga harus tunduk dan patuh menjalankan perintah Allah Subhanahu Wata'ala.
Di area utama bagian dalam masjid, ujar Ismail, terdapat tempat khusus yang biasanya digunakan oleh keluarga keraton untuk beribadah.
Keunikan lainnya di Masjid Agung Sang Cipta Rasa yaitu mimbar bernama Sang Rengga. Mimbar ini berbentuk seperti kursi dan memiliki tiga anak tangga yang menyatu dengan lantai.
Azan saat sholat Jumat di masjid ini dikumandangkan oleh 7 muadzin sehingga d kenal dengan tradisi adzan pitu.