Kapal dikemudikan Nakhoda Kapten Agus Selamet yang hingga kini masih dinyatakan hilang setelah kapal tenggelam. Pencarian terhadap nakhoda dan korban lainnya masih terus dilakukan tim SAR gabungan.
Purgana menyebutkan kemungkinan kapal sudah tenggelam 99,9 persen, mengingat lebih dari tiga jam tidak ada kontak sejak kapal mengirim sinyal darurat (kode merah).
Meskipun insiden ini menimbulkan keprihatinan, operasional pelabuhan di Ketapang masih berlangsung normal. KSOP telah mengerahkan armada kapal dan berkoordinasi dengan operator lainnya untuk mendukung pencarian kapal dan korban.
"Sampai sejauh ini, operasional pelabuhan berjalan normal," kata Purgana.
Kronologi singkat insiden KMP Tunu Pratama Jaya diawali laporan kapal mengalami kebocoran mesin dan mengirim kode merah ke Pelabuhan Gilimanuk, Rabu (2/7/2025) 23.20 WIB. Kemudian kapal dinyatakan tenggelam di koordinat 8° 9'32.35"S – 114°25'6.38"E pukul 23.35 WIB. Data manifes, kapal ini memuat 53 penumpang, 12 kru kapal dan 22 kendaraan dari berbagai jenis.