Dua adiknya bernama Vina Amalia, dan Royhan Akbar.Sama seperti ayahnya, Ikhwan beragama Islam dan kini menetap di Belanda bersama keluarganya.
Ikhwan hobi berolahraga seperti futsal dan juga tenis meja. Selain itu, Ikhwan juga hobi jalan-jalan bersama dengan keluarganya. Ia juga pengagum ayahnya, Mahfud MD.
Pria yang berprofesi sebagai dokter ini telah menikah dengan perempuan yang berprofesi sama yakni dr. Ukhti Jamil Ristiandi pada 2010 lalu. Dari pernikahannya, Ikhwan mempunyai satu orang anak perempuan yang jelita bernama Irada.
Ikhwan juga aktif di media sosial (medsos) Instagram @doc_ikhwan dan memiliki 4.333 followers.
Ikhwan Zein merupakam lulusam Sarjana Kedokteran di Universitas Gadjah Mada pada tahun 2006. Sementara pendidikan profesi doker diselesaikannya pada 2008.